Le Cancéropôle Île-de-France organise, en concertation avec les trois SIRIC d’Île-de-France, PACRI et Saint-Louis Institute, une formation pratique sur le traitement de données massives « NGS et Cancer ». Objectifs : Apprendre de manière pratique à réaliser un traitement complet de données NGS (Next Generation Sequencing) au moyen de l’outil Galaxy Public concerné : Chercheurs franciliens travaillant dans le domaine du cancer débutant dans les NGS Contenu de la formation : La formation pratique se découpe en deux phases :
- une formation individuelle sous la forme de tutoriels vidéo, ouverte à tous
- une formation pratique en salle avec formateurs
Formation pratique en salle : les 2, 3 et 4 décembre 2015 Programme : Analyse des variants génomiques à partir de données d’exome ou de génome complet.
- Présentation des objectifs de chacun, organisation de groupes de stagiaires (en fonction des niveaux et des intérêts)
- Introduction à l’analyse de données NGS
- Détection de variants ponctuelles
- Détection de variants structurels
- Détection de variants du nombre de copies
- Bilan et Restitution
