{"id":33063,"date":"2026-08-26T10:51:16","date_gmt":"2026-08-26T08:51:16","guid":{"rendered":"https:\/\/carpem.fr\/?p=33063"},"modified":"2026-08-26T10:51:16","modified_gmt":"2026-08-26T08:51:16","slug":"resultats-aap-2026-1","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/carpem.fr\/en\/resultats-aap-2026-1\/","title":{"rendered":"Results of AAP 2026-1"},"content":{"rendered":"<div class=\"wpb-content-wrapper\"><p>[vc_row][vc_column][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]D\u00e9couvrez les laur\u00e9ats de notre dernier appel \u00e0 projets 2026-1[\/vc_column_text][vc_separator border_width=&#8221;2&#8243; css=&#8221;&#8221;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<\/p>\n<h4><strong>Post-DoctoraT<\/strong><\/h4>\n<p>[\/vc_column_text][vc_tta_accordion active_section=&#8221;1&#8243;][vc_tta_section title=&#8221;Erwan VO-QUANG&#8221; tab_id=&#8221;1710168775116-f1b3f089-0acd&#8221;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<span style=\"color: #800080;\"><em>Projet<\/em>: <\/span>Apport de la fragmentomique de l\u2019ADN tumoral circulant dans le cancer du pancr\u00e9as m\u00e9tastatique<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>\u00c9quipe<\/em>:<\/span><br \/>\n<em>\u00ab M\u00e9decine Personnalis\u00e9e, Pharmacog\u00e9nomique, Optimisation th\u00e9rapeutique \u00bb, Centre de Recherche des Cordeliers<br \/>\n<\/em><\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>R\u00e9sum\u00e9 grand public<\/em>:<\/span><\/p>\n<p class=\"p1\">Le cancer du pancr\u00e9as est l\u2019un des cancers les plus agressifs et difficiles \u00e0 traiter. Il progresse souvent sans sympt\u00f4mes visibles, ce qui entra\u00eene un diagnostic tardif et un taux de survie tr\u00e8s faible, inf\u00e9rieur \u00e0 10 % apr\u00e8s cinq ans. Les traitements actuels reposent sur la chimioth\u00e9rapie, avec des protocoles comme le FOLFIRINOX ou la combinaison Gemcitabine\/nab-Paclitaxel. Cependant, il est difficile de pr\u00e9dire \u00e0 l\u2019avance qui y r\u00e9pondra favorablement. Pour am\u00e9liorer la prise en charge, les chercheurs d\u00e9veloppent de nouveaux outils permettant d\u2019identifier les patients les plus susceptibles de r\u00e9pondre \u00e0 un traitement donn\u00e9. L\u2019une des approches r\u00e9centes repose sur la fragmentomique de l\u2019ADN tumoral circulant (ADNtc), c\u2019est-\u00e0-dire l\u2019analyse des petits fragments d\u2019ADN lib\u00e9r\u00e9s dans le sang par les cellules canc\u00e9reuses. Cette technique pourrait aider \u00e0 mieux comprendre la signature g\u00e9n\u00e9tique des tumeurs et ainsi guider le choix du traitement de mani\u00e8re plus personnalis\u00e9e. L\u2019objectif du projet est d\u2019\u00e9tudier l\u2019apport de cette technique dans le cancer du pancr\u00e9as m\u00e9tastatique, en analysant des \u00e9chantillons de sang collect\u00e9s avant traitement dans plusieurs \u00e9tudes cliniques. Gr\u00e2ce \u00e0 des m\u00e9thodes avanc\u00e9es de s\u00e9quen\u00e7age et d\u2019analyse informatique, nous esp\u00e9rons identifier des signatures capables de pr\u00e9dire l\u2019efficacit\u00e9 des traitements. \u00c0 terme, ces travaux pourraient permettre d\u2019adapter le traitement \u00e0 chaque patient, am\u00e9liorant ainsi les chances de succ\u00e8s et limitant les effets secondaires.<\/p>\n<p>[\/vc_column_text][\/vc_tta_section][vc_tta_section title=&#8221;Devdeep Mukherjee&#8221; tab_id=&#8221;1710168775116-369d7eaf-a5df&#8221;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<span style=\"color: #800080;\"><em>Projet <\/em>: <\/span>Transposable element-informed immunopeptidome of splicing factor-mutated myeloid neoplasms by single cell proteomics<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>\u00c9quipe <\/em>:<\/span><br \/>\n<em>\u00ab H\u00e9matopo\u00ef\u00e8se normale et pathologique \u00bb, Institut Cochin<\/em><\/p>\n<p><em style=\"color: #800080;\">R\u00e9sum\u00e9 grand public<\/em><span style=\"color: #800080;\">:<\/span><\/p>\n<p class=\"p1\">Les syndromes my\u00e9lodysplasiques (MDS) sont des maladies pr\u00e9leuc\u00e9miques touchant la moelle osseuse par l\u2019accumulation de mutations dans un environnement immunitaire alt\u00e9r\u00e9 par le vieillissement. Aucun traitement curatif n\u2019est disponible en dehors de la greffe de moelle osseuse. Certaines mutations produisent des prot\u00e9ines nouvelles en incorporant des acides amin\u00e9s issus de r\u00e9gions habituellement silencieuses du g\u00e9nome. Nous nous proposons d\u2019identifier ces prot\u00e9ines nouvelles, de d\u00e9terminer si elles sont immunog\u00e8nes c\u2019est-\u00e0-dire si elles peuvent induire une r\u00e9ponse immunitaire de la part de lymphocytes qui les reconnaitraient sp\u00e9cifiquement comme le non-soi. Nous allons inclure dans cette \u00e9tude les \u00e9chantillons de moelle osseuse de patients qui ont donn\u00e9 leur consentement \u00e0 la recherche et qui portent les mutations les plus \u00e0 m\u00eame de produire les nouvelles prot\u00e9ines. Puis nous confirmerons la pr\u00e9sence des nouvelle prot\u00e9ines gr\u00e2ce \u00e0 une technique innovante de prot\u00e9omique \u00e0 l\u2019\u00e9chelle de la cellule unique et enfin nous rechercherons les cellules immunitaires qui reconnaissent ces prot\u00e9ines pour les caract\u00e9riser. Sont-elles activ\u00e9es ou inhib\u00e9es ? L\u2019enjeu est le d\u00e9veloppement d\u2019une immunoth\u00e9rapie cibl\u00e9e qui pourrait \u00eatre mise en oeuvre \u00e0 l\u2019issue denos travaux au sein de groupes coop\u00e9rateurs cliniques fran\u00e7ais et europ\u00e9en.<\/p>\n<p>[\/vc_column_text][\/vc_tta_section][vc_tta_section title=&#8221;Brouna Safi&#8221; tab_id=&#8221;1768230082924-1c11cb13-875b&#8221;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<span style=\"color: #800080;\"><em>Projet<\/em>: <\/span>Deciphering resistance to anti-angiogenic treatments in an engineered perfused vascularised ccRCC spheroid-on-chip model<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>\u00c9quipes<\/em>:<\/span><br \/>\n<em>\u00ab Inflammation, Compl\u00e9ment et Cancer \u00bb, Centre de Recherche des Cordeliers<\/em><\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>R\u00e9sum\u00e9 grand public<\/em>:<\/span><\/p>\n<p class=\"p1\">Le carcinome du rein \u00e0 cellules claires est la forme la plus fr\u00e9quente de cancer du rein. Il se caract\u00e9rise par un r\u00e9seau vasculaire sanguin tr\u00e8s dense qui alimente la tumeur. Bien que plusieurs traitements ciblant les vaisseaux soient aujourd\u2019hui utilis\u00e9s, notamment les inhibiteurs de tyrosine kinases (TKI), leur efficacit\u00e9 est pour de nombreux patients qui d\u00e9veloppent une r\u00e9sistance au traitement. Nos travaux r\u00e9cents ont permis d\u2019identifier dans les tumeurs r\u00e9nales des structures vasculaires aberrantes. Certaines, que nous avons appel\u00e9es \u00e9tangs, prennent la forme de larges cavit\u00e9s contenant du sang, tandis que d\u2019autres, que nous avons appel\u00e9es feuillets, sont longues, fines et aplaties. Ces structures aberrantes pourraient favoriser la progression de la tumeur primaire, la diss\u00e9mination m\u00e9tastatique et la r\u00e9sistance aux traitements. Afin de comprendre leur r\u00f4le, nous avons d\u00e9velopp\u00e9 un mod\u00e8le tridimensionnel reproduisant en laboratoire les interactions entre cellules tumorales, cellules des vaisseaux sanguins et fibroblastes, des cellules de soutien pr\u00e9sentes dans les tumeurs. Ce premier mod\u00e8le a permis de reproduire les \u00e9tangs, mais il ne reproduit pas la totalit\u00e9 du r\u00e9seau vasculaire observ\u00e9e chez les patients \u00e9tant incapable de g\u00e9n\u00e9rer les feuillets. Le projet, \u00e0 l\u2019interface entre l\u2019ing\u00e9nierie, la biologie et la clinique vise \u00e0 d\u00e9velopper un mod\u00e8le innovant utilisant des technologies microfluidiques permettant d\u2019\u00e9tablir un r\u00e9seau microvasculaire perfus\u00e9 au contact de sph\u00e9ro\u00efdes tumoraux. Nous \u00e9tudierons comment les forces m\u00e9caniques, la pression des fluides et les fibroblastes influencent la formation des \u00e9tangs et des feuillets et leur sensibilit\u00e9 aux traitements TKI actuellement utilis\u00e9s contre le cancer du rein. Ce mod\u00e8le fournit une alternative innovante \u00e0 l\u2019exp\u00e9rimentation animale et permettra de mieux comprendre pourquoi certains patients sont r\u00e9sistants aux traitements. Il pourra \u00e9galement servir \u00e0 tester de nouvelles strat\u00e9gies th\u00e9rapeutiques et, \u00e0 plus long terme, contribuer au d\u00e9veloppement d\u2019approches plus personnalis\u00e9es pour les patients atteints de cancer du rein.<\/p>\n<p>[\/vc_column_text][\/vc_tta_section][\/vc_tta_accordion][vc_separator border_width=&#8221;2&#8243; css=&#8221;&#8221;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<\/p>\n<h4><strong>AIDE AU FINANCEMENT D&#8217;UNE FIN DE TH\u00c8SE\u00a0<\/strong><\/h4>\n<p>[\/vc_column_text][vc_tta_accordion active_section=&#8221;1&#8243;][vc_tta_section title=&#8221;Marie Valet&#8221; tab_id=&#8221;1787733242522-a14bfca1-d0b7&#8243;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<span style=\"color: #800080;\"><em>Projet<\/em>: <\/span>Le GABA intestinal dans le syndrome m\u00e9tabolique et l\u2019immunosupression associ\u00e9s au cancer<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>PIs<\/em>: <\/span>Guido Kroemer &amp; Maria Castedo<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>\u00c9quipe<\/em>:<\/span><br \/>\n<em>\u00ab M\u00e9tabolisme, Cancer et Immunit\u00e9\u00bb, Centre de Recherche des Cordeliers<br \/>\n<\/em><\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>R\u00e9sum\u00e9 grand public<\/em>:<\/span><\/p>\n<p class=\"p1\">Le cancer du poumon est le deuxi\u00e8me cancer le plus fr\u00e9quent chez l\u2019homme et le troisi\u00e8me chez la femme. Le cancer du poumon non \u00e0 petites cellules (CBNPC) repr\u00e9sente 80% des cancers du poumon chez l\u2019Humain. Il est souvent d\u00e9tect\u00e9 \u00e0 un stade avanc\u00e9 et le taux de survie \u00e0 5 ans est faible, en raison d\u2019une mauvaise r\u00e9ponse aux th\u00e9rapies anti-canc\u00e9reuses, dont les immunoth\u00e9rapies font partie. Aujourd\u2019hui, il est essentiel d\u2019en identifier les causes et de trouver des strat\u00e9gies permettant d\u2019y rem\u00e9dier. R\u00e9cemment, nous avons obtenu des donn\u00e9es indiquant que la r\u00e9ponse aux immunoth\u00e9rapies chez des patients atteints de CBNPC est li\u00e9 \u00e0 une alt\u00e9ration de la composition du microbiote intestinal impliqu\u00e9 dans la m\u00e9tabolisation d\u2019un acide amin\u00e9. On observe notamment une association entre la pr\u00e9sence de bact\u00e9ries intestinales impliqu\u00e9es dans la d\u00e9gradation de ce m\u00e9tabolite et une augmentation de la survie chez les patients atteints de CBNPC et trait\u00e9s avec des immunoth\u00e9rapies. Mon sujet de th\u00e8se vise \u00e0 comprendre le r\u00f4le de cet acide amin\u00e9 dans des mod\u00e8les murins de CBNPC et \u00e0 identifier des moyens de contrer ses effets. Pour cela, j\u2019\u00e9tudie les interactions entre m\u00e9tabolisme, cancer et immunit\u00e9. Au cours des trois premi\u00e8res ann\u00e9es de th\u00e8se, j\u2019ai d\u00e9montr\u00e9 que cet acide amin\u00e9 favorise la croissance tumorale et r\u00e9duit l\u2019efficacit\u00e9 des immunoth\u00e9rapies. Cet effet peut \u00eatre contrecarr\u00e9 par l\u2019administration d\u2019une bact\u00e9rie impliqu\u00e9e dans sa d\u00e9gradation, qui diminue la croissance tumorale et am\u00e9liore la survie des souris. La quatri\u00e8me ann\u00e9e de th\u00e8se sera consacr\u00e9e \u00e0 l\u2019\u00e9tude approfondie du potentiel th\u00e9rapeutique de cette bact\u00e9rie, afin d\u2019\u00e9valuer son utilisation comme probiotique et d\u2019identifier de nouveaux marqueurs m\u00e9taboliques pronostiques et\/ou pr\u00e9dictifs de la r\u00e9ponse aux traitements. \u00c0 terme, ces r\u00e9sultats pourraient am\u00e9liorer la prise en charge des patients atteints de CBNPC.<\/p>\n<p>[\/vc_column_text][\/vc_tta_section][\/vc_tta_accordion][vc_separator border_width=&#8221;2&#8243; css=&#8221;&#8221;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<\/p>\n<h4><strong>MASTER 2 RECHERCHE<\/strong><\/h4>\n<p>[\/vc_column_text][vc_tta_accordion active_section=&#8221;1&#8243;][vc_tta_section title=&#8221;FAUSTINE NOUVEL&#8221; tab_id=&#8221;1787733828193-553fd585-9f53&#8243;][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]<span style=\"color: #800080;\"><em>Projet<\/em>: <\/span>Approches prot\u00e9omiques pour caract\u00e9riser les m\u00e9canismes mol\u00e9culaires sous-jacents \u00e0 l\u2019essentialit\u00e9 de certaines E3-ligases dans les carcinomes bronchiques non \u00e0 petites cellules porteurs de mutations somatiques de NF1.<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>PIs<\/em>: <\/span>Jean-St\u00e9phane Giraud &amp; Camille Tlemsani<\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>\u00c9quipe<\/em>:<\/span><br \/>\n<em>\u00ab G\u00e9nomique et \u00e9pig\u00e9n\u00e9tique des tumeurs rares\u00bb, Institut Cochin<br \/>\n<\/em><\/p>\n<p><span style=\"color: #800080;\"><em>R\u00e9sum\u00e9 grand public<\/em>:<\/span><\/p>\n<p class=\"p1\">Les ad\u00e9nocarcinomes pulmonaires sont un type fr\u00e9quent de cancer du poumon, souvent diagnostiqu\u00e9s \u00e0 un stade avanc\u00e9. Leur prise en charge a \u00e9t\u00e9 transform\u00e9e par la d\u00e9couverte de mutations intratumorales. Des traitements ciblant ces mutations ont permis une am\u00e9lioration de la survie. Toutefois, environ 50 % des patients n&#8217;ont encore acc\u00e8s \u00e0 aucune th\u00e9rapie cibl\u00e9e efficace. C&#8217;est le cas des patients dont la tumeur pr\u00e9sente une alt\u00e9ration du g\u00e8ne NF1, un g\u00e8ne dit \u00ab suppresseur de tumeur \u00bb dont la fonction normale est de freiner la croissance des cellules canc\u00e9reuses. Mon \u00e9quipe d\u2019accueil a mis en \u00e9vidence que 15% des ad\u00e9nocarcinomes bronchiques pr\u00e9sentent une mutation de NF1 et a d\u00e9velopp\u00e9 des mod\u00e8les cellulaires de cancer pulmonaire mut\u00e9 NF1. Mon \u00e9quipe s&#8217;est ensuite int\u00e9ress\u00e9e \u00e0 identifier des traitements pour ces patients. Pour cela, ils ont eu recours \u00e0 une strat\u00e9gie innovante appel\u00e9e la \u00ab l\u00e9talit\u00e9 synth\u00e9tique \u00bb : l&#8217;id\u00e9e est de trouver un second g\u00e8ne qui, lorsqu&#8217;il est inactiv\u00e9 en m\u00eame temps que NF1, entra\u00eene la mort s\u00e9lective des cellules canc\u00e9reuses, sans affecter les cellules saines. Cette approche, rendue possible gr\u00e2ce \u00e0 des technologies d&#8217;\u00e9dition du g\u00e9nome (CRISPR-Cas9), leur a permis d&#8217;identifier cinq g\u00e8nes candidats prometteurs, tous impliqu\u00e9s dans un syst\u00e8me cellulaire essentiel : le syst\u00e8me ubiquitine-prot\u00e9asome, qui joue le r\u00f4le d&#8217;une \u00ab poubelle \u00bb charg\u00e9e d&#8217;\u00e9liminer les prot\u00e9ines d\u00e9fectueuses ou en exc\u00e8s dans la cellule. Pour mieux comprendre pourquoi ces g\u00e8nes deviennent indispensables \u00e0 la survie des cellules tumorales lorsque NF1 est mut\u00e9, nous allons analyser l&#8217;ensemble des prot\u00e9ines et le processus de d\u00e9gradation prot\u00e9ique \u00ab d\u2019ubiquitination \u00bb \u00e0 l&#8217;oeuvre dans des cellules pulmonaires avec ou sans mutation de NF1 par \u00ab spectrom\u00e9trie de masse \u00bb. \u00c0 terme, ces travaux pourraient ouvrir la voie \u00e0 de nouveaux traitements cibl\u00e9s pour les patients atteints d\u2019ad\u00e9nocarcinomes bronchiques porteurs d&#8217;une mutation NF1.<\/p>\n<p>[\/vc_column_text][\/vc_tta_section][\/vc_tta_accordion][\/vc_column][\/vc_row]<\/p>\n<\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>[vc_row][vc_column][vc_column_text css=&#8221;&#8221;]D\u00e9couvrez les laur\u00e9ats de notre dernier appel \u00e0 projets 2026-1[\/vc_column_text][vc_separator&#8230;<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":31782,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[313],"tags":[],"class_list":["post-33063","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","category-call-for-projects-applications"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v28.2 - 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