Plateforme de protéomique

Plateforme de protéomique : 3p5

Dès sa constitution, l’Institut Cochin a mis en place un plateau technique de microanalyse des protéines. Il a ensuite fortement contribué à l’installation de la plate-forme de protéomique de l’Université Paris Descartes (3P5) qu’il héberge dans ses locaux. Les activités de la plate-forme de protéomique de l’Institut Cochin et celles de la plate-forme protéomique universitaire sont complémentaires et sont désormais fusionnées sous le terme de : Plateforme Protéomique de l’Université Paris Descartes (3P5).

Elle regroupe des appareils et le personnel de la plate-forme de protéomique de l’Institut Cochin qui développe des techniques d’analyse des protéomes essentiellement basées sur l’électrophorèse bidimensionnelle ainsi que le personnel de la plate-forme protéomique de l’Université Paris Descartes et ses appareils de spectrométrie haute performance pour l’identification et la microanalyse des protéines. La plate-forme 3P5 réalise des identifications de protéines en solution ou à partir de fragments de gels d’électrophorèse, des analyses de modifications post-traductionnelles (acétylation, hydroxylation, méthylation, phosphorylation, etc.) et des analyses quantitatives comparées de protéomes complexes. La plate-forme 3P5 est labellisée par le GIS-IBISA (Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie).

Équipements :

  • Première dimension : 3 IPGphor (GE Healthcare) avec Manifold pour l’électrofocalisation des protéines
  • Deuxième dimension : 2 appareils Ettan-Dalt12 (GE Healthcare) et 2 appareils Ettan-Dalt6 (GE Healthcare) pour la migration respectivement de 12 ou 6 gels SDS-PAGE.
  • Prélèvement des spots : 1 robot Spot Picker (GE Healthcare) pour le prélèvement des spots de nos gels E2D.
  • Etudes des modifications post-traductionnelles (Phosphorylations) : 1 appareil NanoPro1000 (ProteinSimple)

Contacts

Institut Cochin

22 rue Méchain – 75014 Paris

Équipe : Patrick Mayeux, Philippe Chafey, François Guillonneau, Cédric Broussard…

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